形态学实验教学中心成立于2002年，由病理学实验室、组织胚胎学实验室和生物学实验室组合而成，设主任1人，副主任2人，负责中心实验室设备及教学的协调和管理等。

中心拥有一支具有丰富教学经验的实验教师队伍，现有教师46人，其中具有高级专业技术职称的21人，具有硕士及以上学位的34人；专职实验技术人员5人，其中，高级实验师1人，具有硕士学位3人；工人1人。实验教学队伍数量适宜、核心骨干相对稳定、结构合理、年龄有梯次。

中心建筑总面积5598m2，其中数字化教学实验室6个，普通形态学实验室5个，细胞生物学实验室2个，按设计标准可同时容纳780多名学生上形态学实验课。另有实验教学准备用房600m2，标本陈列室300m2。拥有全新的学生用奥林巴斯显微镜、进口高级研究用显微镜、进口倒置显微镜及其成像系统、较为精密贵重的徕卡切片机、包埋机、烤片机及脱水机、恒温冷冻切片机以及二氧化碳培养箱、冰冻离心机和多媒体图象分析系统等先进的实验教学设备和优良的实验教学家具和先进的数字化实验教学平台，总值约921万元，能够满足各专业、各层次实验教学需要。

中心主要承担院内本科、研究生和留学生的《病理学》、《妇产科病理学》、《口腔组织病理学》、《组织胚胎学》、《医学生物学》、《分子病理学进展》、《组织病理技术》、《组织胚胎学高级课程》、《医学细胞生物学》及《细胞生物学进展》的实验教学和实验标本、切片制作等实验教学准备及其它工作。

中心一贯重视实验教学工作，编写有供各专业使用的实验教学大纲，实验教材及各种实验教学管理制度。所属各实验室在实验项目的开设上，严格按照我院本科学生的培养目标设定，教学中注重培养学生的观察能力、综合分析和解决问题的能力。经过多年的建设，在实验教学理念、实验教学体系、实验教学内容、实验技术装备、实验队伍建设、实验管理制度等方面均取得了显著成效，2013年被评为“川北医学院实验教学示范中心”，“医学显微形态学科数字化实验教学体系的改革与实践”获得四川省2014-2016年高等教育人才培养质量和教学改革项目立项资助。